加拿大的研究人员开发了一种称为MultimMR的综合遗传/表观遗传DNA测序议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议定议,其可以在结肠,子宫内膜和其他癌症中的小型DNA样品中识别失配修复(MMR)缺乏的缺陷。1这种替代方案复杂,多步测试工作流还可以确定MMR缺乏的原因,通常通过当前的临床测试错过。

MMR基因监测和修复正常细胞复制和重组中可能发生的误差。在一些遗传和获得的癌症中,失活的一种或多种MMR基因。

“多媒体的影响广泛。亚博足彩app苹果版肿瘤对新癌症免疫治疗的肿瘤反应良好,“多伦多大学博士”博士“博士”以及在多伦多的安大略省癌症研究所。“确定个体是否具有遗传形式的MMR缺乏,也可以允许临床医生注册积极监测的患者,从事风险减少策略,并为亲属提供基因检测 - 可能改善患者结果。”

MMR缺乏的标准临床检测可能不一致,需要多种测试和类型的专业知识,从而为患者提供次优。下一代测序试验具有普及,并用于临床实验室。但是,它们不确定MMR缺乏的所有遗传变异,并且通常需要额外的测试。

多媒体同时测试启动子甲基化,突变,拷贝数状态,复制杂合性的中性损失,以及来自少量DNA的微卫星不稳定性。在这项研究中,研究人员从82名MMR相关结直肠癌,子宫内膜和脑癌的82名试样(82正常和60颗肿瘤样本)中序的DNA。亚博足彩app苹果版作为阳性对照,将45名患者的结果与先前使用常规测定的临床试验进行比较。它们还使用MultimMR来概况市售的DNA对照,其包括11个变体,该变体具有挑战以利用下一代测序检测。

为了检测MMR缺乏的存在,分别发现MulmMR启动子甲基化和微卫星不稳定性分析与临床试验分别发现95%和97%的一致性。在检测负责MMR缺乏的变体中,MultimMR匹配24例中的23例临床检测结果。该试验鉴定了多个测序中的合成混合物中的所有11个突变,并确定了29例残疾患者的不匹配修复缺陷。该小组能够识别目前临床级联经常错过的MMR的原因。

“我们已经表明,MMR的存在和原因可以在单个测试中,从单个等分试样的DNA中可以确定,从而充分利用可用的组织,简化工作流程,改善林奇和相关世文育癌症的综合报告,”领导作者莱斯利古菲尔德,多伦多大学麦尔斯特·玛格丽特公主癌症中心,大学卫生网络在多伦多。

研究人员指出,目前的级联测试协议可能无法满足结肠直肠和子宫内膜癌症患者对通用肿瘤检测的需求增加。亚博足彩app苹果版例如,许多下一代测序试验不会筛选微卫星不稳定性和促进剂甲基化,例如侧面突变。

“免疫疗法的资格往往对MMR地位占有目的,所以及时且鲁棒的测试很重要,”Oldfield说。“多媒体简化了过程,并区分了MMR缺陷的类型随着提高的周转时间,可以随着需求的增加而展现得很好,并且可以提供临床医生,并提供重要信息以告知患者管理和治疗决策。”

参考

1. Oldfield Le,Li T,Tone A等人。一种集成DNA测序和甲基化面板,以评估不匹配修复缺陷。J Mol Diagn。2020; S1525-1578(20)30580-8。DOI:10.1016 / J.Jmoldx.2020.11.006