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Imec的ElPrep软件速度基因组测序分析

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DNA测序分析

创新者Imec纳电子学和数字技术,鲁汶比利时,最近推出ElPrep 4.0,公司的最新版本的软件工具来加速人类DNA测序分析。

根据Imec,ElPrep 4.0加速全基因组外显子组处理管道通过一个数量级,拯救一个典型的实验室数百小时的计算机处理时间和促进更快的完成更DNA测试。ElPrep 4.0设计替代准备步骤定义的基因组分析工具箱最佳实践管道进行变体的召唤,同时提供相同的结果。

人类基因组DNA测序包括分裂成成千上万的碎片,然后美联储基因组测序识别个人的基地。文件处理过程导致巨大的数据通过一个管道的工具来重建原始的DNA序列,和识别变异遗传疾病。人类全基因组DNA数据集通常是几百gb的未压缩的数据,导致数万小时基因组的典型处理时间。

ElPrep 4.0执行所有步骤准备DNA测序变体调用。它可以取代等DNA测序分析软件GATK 4.0,皮卡德,SAMtools,而产生相同的结果。ElPrep软件的体系结构使它能够执行分析管道只有一个通过数据,无论多久的管道。

ElPrep被设计为运行多线程应用程序完全在内存中,避免重复文件输入/输出,和合并的数据计算了DNA测序的准备步骤。在一个典型的运行,Imec说ElPrep软件要多十倍的速度比其他软件工具使用相同的资源。yabo体育苹果下载地址

为进一步的信息,访问Imec

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